A Segunda Guerra Mundial não gerou mudança apenas no nome da instituição. Por influência direta do conflito, o escudo do clube foi alterado pela primeira vez em abril de 1942, subtraindo-se a cor vermelha e utilizando o verde, o amarelo e o branco, já com a nova denominação de Palestra de São Paulo. Em setembro de 1942, com a troca de nome para Palmeiras, surgiu o terceiro e definitivo escudo, que é utilizado até hoje. Em seu desenho, estão presentes apenas as cores verde e branca, além das referências à data da fundação do clube (26/8): 26 linhas horizontais dentro do brasão e 8 estrelas dentro de sua circunferência.
Se o escudo institucional teve três versões diferentes ao longo da história, o distintivo usado na camisa teve nove. Entre 1937 e 1942, vinha sendo utilizado como símbolo um círculo verde com as letras P e I escritas em vermelho. Mas, como consequência da Segunda Guerra, subtraiu-se o I do símbolo e trocou-se a cor vermelha do P pela branca. Este emblema foi utilizado até 1959, quando, finalmente, o distintivo da camisa passou a ser igual ao escudo do clube.