O Palmeiras garantiu vaga na Libertadores de 1999 ao se sagrar campeão da Copa do Brasil de 1998. Com um superesquadrão montado pelo técnico Luiz Felipe Scolari, finalmente o Verdão conseguiu quebrar o tabu e levantar o troféu mais importante da América do Sul. As honras, porém, ficaram para um certo goleiro chamado Marcos, que em questão de meses passou de quase desconhecido à condição de divindade no Palestra Italia.
Foi em 1999 que Marcos assumiu a titularidade do Palmeiras. Substituiu o contundido Velloso ainda na fase de grupos, ajudou a equipe a eliminar o então campeão Vasco nas oitavas de final e foi canonizado contra o Corinthians, nas quartas de final, em confronto que ficou conhecido como o Dérbi do Século – o camisa 12 fechou o gol nas duas partidas e ainda brilhou na cobrança de pênaltis, recebendo a eterna alcunha de São Marcos.
O Palmeiras deixou para trás o River Plate (ARG) nas semifinais e encarou o Deportivo Cali (COL) na grande decisão. Após a derrota por 1 a 0 na casa do adversário, o Alviverde venceu o rival por 2 a 1 no Palestra Italia (gols de Evair e Oséas). O título, então, seria decidido nos pênaltis. E após duas cobranças erradas dos colombianos, o Palmeiras venceu por 4 a 3 e atingiu a glória máxima no continente. De quebra, o zagueiro Junior Baiano, com cinco gols, foi o vice-artilheiro da competição, e Marcos se tornou o primeiro goleiro da história a ser eleito o melhor jogador de uma edição da Libertadores.
Depois de uma vitória para cada lado, duelo vai para os pênaltis e Marcos é canonizado
Decisão por pênaltis contra o Corinthians
Palmeiras precisava de vencer por 2 gols de diferença. Fez mais que isso: 3 a 0 com show de Alex
Verdão bate Deportivo Cali por 2 a 1 no tempo normal e conquista a Libertadores nos pênaltis
Campanha
14 jogos, 7 vitórias, 2 empates, 5 derrotas, 24 gols marcados, 18 gols sofridos.
Técnico
Luiz Felipe Scolari.
| Jogador | Posição | Jogos | Vitórias | Empates | Derrotas | Gols | 
|---|---|---|---|---|---|---|
| Alex | Meia | 14 | 7 | 2 | 5 | 4 | 
| Arce | Lateral-direito | 14 | 7 | 2 | 5 | 3 | 
| Oséas | Atacante | 14 | 7 | 2 | 5 | 4 | 
| Paulo Nunes | Atacante | 14 | 7 | 2 | 5 | 3 | 
| Zinho | Meia | 14 | 7 | 2 | 5 | 0 | 
| Galeano | Volante | 13 | 6 | 2 | 5 | 0 | 
| Junior Baiano | Zagueiro | 13 | 6 | 2 | 5 | 5 | 
| Rogério | Lateral-direito e volante | 13 | 7 | 1 | 5 | 1 | 
| Evair | Atacante | 12 | 6 | 2 | 4 | 2 | 
| César Sampaio | Volante | 11 | 6 | 1 | 4 | 0 | 
| Cléber | Zagueiro | 11 | 5 | 2 | 4 | 1 | 
| Júnior | Lateral-esquerdo | 11 | 5 | 2 | 4 | 0 | 
| Marcos | Goleiro | 10 | 5 | 1 | 4 | -11 | 
| Roque Junior | Zagueiro | 9 | 5 | 1 | 3 | 1 | 
| Jackson | Meia | 7 | 3 | 2 | 2 | 0 | 
| Euller | Atacante | 4 | 2 | 0 | 2 | 0 | 
| Velloso | Goleiro | 4 | 2 | 1 | 1 | -7 | 
| Rúbens Junior | Lateral-esquerdo | 3 | 2 | 0 | 1 | 0 | 
| Aguinaldo | Zagueiro | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 
| Rivarola | Zagueiro | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 
| Tiago Silva | Lateral-esquerdo e volante | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 
| Técnico | Jogos | Vitórias | Empates | Derrotas | 
|---|---|---|---|---|
| Felipão | 14 | 7 | 2 | 5 |