Repetindo o feito do ano anterior, o Verdão chegou mais uma vez a uma final de Libertadores. Em 2000, porém, a história não teve final feliz. Após dois angustiantes empates nos jogos finais (2 a 2 em La Bombonera e 0 a 0 no Morumbi), Palmeiras e Boca Juniors decidiram o título nas penalidades. Desta vez, o Alviverde foi superado por 4 a 2.
Apesar de não conquistar o título, o Verdão também proporcionou aos torcedores momentos de alegria em sua trajetória. O mais memorável deles foi, sem dúvidas, a eliminação do rival Corinthians, nas penalidades, quando o goleiro Marcos trucidou o sonho do arquirrival de chegar pela primeira vez a uma decisão de Libertadores defendendo o chute derradeiro de Marcelinho Carioca – pela segunda vez consecutiva, o Palmeiras eliminava o Corinthians exatamente da mesma maneira, desta vez, porém, nas semifinais. O rival só conseguiria chegar a uma final de Libertadores 12 anos depois.
Durante a campanha, o time de Luiz Felipe Scolari, que contava com um astro internacional em suas fileiras (o colombiano Asprilla), ainda aplicou goleadas em Juventude, The Strongest (BOL) e El Nacional (EQU), além de eliminar o tradicional Peñarol (URU).
Campanha
14 jogos, 7 vitórias, 3 empates, 4 derrotas, 32 gols marcados, 23 gols sofridos.
Técnico
Luiz Felipe Scolari
| Jogador | Posição | Jogos | Vitórias | Empates | Derrotas | Gols | 
|---|---|---|---|---|---|---|
| Argel | Zagueiro | 14 | 7 | 3 | 4 | 1 | 
| Júnior | Lateral-esquerdo | 14 | 7 | 3 | 4 | 3 | 
| Marcos | Goleiro | 14 | 7 | 3 | 4 | -23 | 
| Rogério | Lateral-direito e volante | 14 | 7 | 3 | 4 | 3 | 
| Alex | Meia | 13 | 7 | 3 | 3 | 4 | 
| Galeano | Volante | 13 | 6 | 3 | 4 | 2 | 
| Pena | Atacante | 13 | 6 | 3 | 4 | 5 | 
| César Sampaio | Volante | 12 | 5 | 3 | 4 | 1 | 
| Euller | Atacante | 12 | 7 | 3 | 2 | 4 | 
| Asprilla | Atacante | 8 | 3 | 3 | 2 | 1 | 
| Marcelo Ramos | Atacante | 8 | 4 | 2 | 2 | 3 | 
| Tiago Silva | Lateral-esquerdo e volante | 8 | 5 | 2 | 1 | 0 | 
| Basílio | Atacante | 7 | 3 | 2 | 2 | 1 | 
| Neném | Lateral-direito | 7 | 3 | 2 | 2 | 1 | 
| Roque Junior | Zagueiro | 7 | 3 | 2 | 2 | 1 | 
| Fernando | Volante | 6 | 4 | 0 | 2 | 0 | 
| Aguinaldo | Zagueiro | 5 | 2 | 1 | 2 | 0 | 
| Arce | Lateral-direito | 5 | 3 | 0 | 2 | 1 | 
| Juliano | Atacante | 3 | 2 | 0 | 1 | 0 | 
| Índio | Zagueiro | 2 | 1 | 0 | 1 | 0 | 
| Jackson | Meia | 2 | 1 | 0 | 1 | 0 | 
| Taddei | Volante | 2 | 2 | 0 | 0 | 1 | 
| Ferrugem | Volante | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 
| Luís Cláudio | Atacante | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 
| Técnico | Jogos | Vitórias | Empates | Derrotas | 
|---|---|---|---|---|
| Felipão | 14 | 7 | 3 | 4 |