Revelado pelo Vasco, Danilo foi para o Sporting Braga-POR com 18 anos recém-completados, no meio de 2014, quando tinha acabado de ser promovido ao time profissional do clube carioca (atuou em nove partidas, sendo sete como titular). Depois, foi emprestado para Valencia-ESP, Benfica-POR e Standard Liége-BEL antes de retornar ao Braga e trabalhar com Abel Ferreira na temporada 2017-18 (atuou em 46 partidas e anotou quatro gols). Em seguida, foi adquirido pelo Nice-FRA.

Destaque desde cedo, o jogador de 1,83m de altura pode atuar também como zagueiro e foi convocado em todas as categorias de base da Seleção Brasileira. Chamado pela primeira vez em 2010, foi campeão sul-americano sub-15 já em 2011. Em 2015, foi vice-campeão mundial sub-20 na Nova Zelândia junto dos palmeirenses João Pedro e Gabriel Jesus (perdendo a final para a Sérvia na prorrogação) e eleito o segundo melhor jogador do torneio (Bola de Prata). Em grande parte de suas participações vestindo a Amarelinha, Danilo foi capitão, inclusive na Copa do Mundo Sub-20.